米兰的成功更多要归功于来自巴黎圣日耳曼的新援乔治-维阿，而非来自斑马军团的巴乔。因此尽管在两个赛季里分别代表两家俱乐部获得意甲冠军，但他并非最大功臣，而此后的巴乔再未获得过意甲冠军。

　　萨基重聚

　　那个夏天，将他接到米兰城的法比奥-卡佩罗远走皇家马德里，米兰主帅变成了乌拉圭人塔巴雷斯。1996/97赛季伊始，巴乔和维阿搭档锋线，表现出色。然而随后他们在冠军杯早早出局，因为夏季引援不力，联赛中也逐步下滑，这让塔巴雷斯被炒了鱿鱼。巴乔此前在国家队的主帅萨基来到了圣西罗与其团聚。然而对于巴乔来说，事情并未变得更好。“我感觉就像是一台法拉利让一位交通警在开，”巴乔对他越来越少的一队出阵时间感到忿忿不平。而那也成为了米兰许多年以来最糟糕的一个赛季。

　　在西班牙度过一个赛季之后，卡佩罗回到了米兰，但他让巴乔以自由身离开了圣西罗。在短短3年间，巴乔迅速陨落，以一种很不公平的方式，尽管他的比赛不再像过去那般流畅丝滑，但他终究是三年两夺意甲冠军。在30岁的年纪时，巴乔已经告别了神坛。

　　博洛尼亚重生

　　在被时任帕尔马主帅安切洛蒂拒绝之后，巴乔加入了中游球队博洛尼亚，目标是在1998年法国世界杯时重返国家队。在彼时，这个目标显得不切实际。有了皮耶罗、维埃里、因扎吉以及冉冉升起的托蒂，谁还需要巴乔？

　　“足球世界里，人们的记忆力很短，”巴乔说道，“就目前而言，我依然是意大利国家队进球最多的人，而过去三年间我几乎没有为国家队出过场。”来到博洛尼亚的巴乔剪掉了标志性的马尾辫，许多人认为这是巴乔在削发明志，然而当事人表示，“这并没有什么特别的含义，我只是觉得厌烦了那个发型，就决定剪掉了。”然而1997/98赛季巴乔确实打出了近年来难得一见的高光表现。单骑闯关也许少了一些，但新面貌的巴乔在效率和杀伤力方面却更加突出。

　　他拿球依然稳健，在狭小空间里闪转腾挪依然不在话下。在控球处于劣势的博洛尼亚，他的决断力和节奏感都有了许多进步，而在有限的控球机会时，他也能当仁不让地化腐朽为神奇。

　　在更加靠前的位置上，巴乔和瑞典锋霸安德森组成了超级搭档。除了保持自己的做球能力之外，巴乔现在也成为了一位门前杀手。当赛季巴乔打进了意甲单赛季最多的进球，超越了巅峰时期的巴蒂斯图塔和皮耶罗。曾经令球迷如痴如醉的各种挑射、任意球和带球过掉门将又一次出现在了巴乔的比赛中。