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NGS文库均一化技术哪家强?,Swift Normalase试剂盒
2021-06-08 10:45 上海仁科生物

Swift Biosciences

Swiftbio位于美国安娜堡,2013年进入NGS市场,专业设计生产DNA/RNA建库试剂盒及配套试剂,产品被各类科研机构及商业公司广泛使用

Swift Normalase为一种新型酶促反应的文库均一化试剂盒,可产生具有指定摩尔浓度的上机测序混样文库。无需测序前进行文库定量和浓度调整,还可得到最佳测序成簇密度及index平衡文库。与基于磁珠筛选均一化方案相比,不受限于样本混合数量进行固定反应,节省了时间的同时,提升了表现性能。

文库PCR扩增后,只需孵育混有Normalase试剂的文库,即可均一化不同产量的文库至等摩尔浓度,实现了后续简单混样。经Normalase均一化的文库,无需额外纯化步骤,可直接上机测序。Normalase允许不同文库间其产量差别大于10倍,即使如此,同一混样池的文库其测序成簇差异小于10%

测序结果显示,经Normalase均一化的文库,其覆盖率、文库分子复杂度、碱基组成、覆盖均一性等性能指标并不受影响。Normalase减少了高通量测序样本制备流程、实验操作步骤、成本的同时,降低文库上机偏差, 实验最终数据分析结果(如等位基因频率)也并不受影响。此外,Normalase结果并不受文库片段大小影响,特别有利于转座子文库或酶切产生的文库,因为其片段大小分布广泛,使摩尔浓度计算复杂化。Normalase试剂盒还可以用于杂交捕获实验方案中,对捕获前及捕获后的文库均一化,提高了捕获及测序数据覆盖的均一性。

Swift Normalase流程介绍

Normalase工作流程起始于文库制备环节(见下图),用Normalase引物替换传统文库扩增引物,按照原有建库流程进行磁珠纯化即可,无需再做文库定量。传统工作流程则需要手工对已扩增好文库进行定量、稀释及混样上机。与之相比,Normalase实验只包含两步骤、分别十五分钟孵育,酶无偏好性的筛选等摩尔量文库,混合后可得到均一化的、可直接上机测序且单独都为4nM的文库混合池。

使用Normalase引物扩增带有样本标签的常规文库至12nM以上,经过Normalase I和II孵育,完成整个文库均一化过程。Normalase I反应起始于文库扩增后纯化步骤,在该环节酶无偏好性的选择每个文库4nM。之后,将所有库都等体积的合并到一个混合池中。通过酶法,Normalase II反应将混合池中的所有文库标准化至4nM。无需进一步纯化,该混合文库池可直接用于测序。

标签: 技术 哪家 文库 试剂盒
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