百万元资助百个物种空间图谱构建
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生命活动过程研究从宏观的个体器官组织到微观的单个细胞甚至微小空间区域充满者无限奥秘,借助于空间组学技术的发展,我们得以畅游生命体微元新世界,开辟组织细胞内部新天地。
空间转录组开创革命性的技术突破,通过肉眼可视化分子在不同的空间区域的表达情况,解析组织在空间上的异质性,在空间图谱、胚胎发育、神经科学、免疫感染、胁迫应激、生物进化等方面有着广泛应用。
近来空间转录组技术在物种上有了新的突破,不再局限于人和鼠常见的模式物种,已经开始迈入哺乳动物(猪)、家禽类(鸡)、植物类(拟南芥、云杉、杨树)等新的物种领域,极大拓展其应用范围,但是相对于整个生物界来说,还有大量的物种空间组学图谱亟需探索。
图1 已发表高通量空间转录组测序文献物种组织类型统计(data from PubMed)
构建空间转录组图谱是了解组织空间结构、探索组织时空发育和适应性进化的基础。目前,已有多个物种已经完成空间转录组图谱的构建。为促进更多物种完成空间组学图谱的构建,百迈客生物重磅出击,推出空间转录组“双百计划”,出资百万元资助百个物种完成空间转录组图谱,助力探索更多物种空间组学奥秘。
多个物种已经完成空间图谱构建
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空间转录组技术广泛用于探索各种物种发育不同阶段组织空间基因表达模式特征,揭示组织空间异质性,重新定义新的功能组织区域,提供分子在空间维度调控网络的新视角。
图2. 已发表各物种组织空间图谱构建参考文献
百迈客助力多物种空间图谱构建(部分项目展示)
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动植物项目共累计30余种物种, 其中植物项目经验高达10余种,建立完善动植物组织透化体系,主要包括动物心、肝、脾、肺、肾;植物茎、芽、花、种子等200余种组织类型。
图3 百迈客各物种空间转录组图谱构建项目经验(部分)
空间转录组双“百”计划样本征集
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