铁轨上、车站中，一个个的弹印和一个个的弹坑，是写在钢铁上的证词，诉说着日军狂轰滥炸的罪恶行径。在日军的狂轰滥炸下，在2年多时间里，铁路运输仍未被完全切断，使滇越铁路一度成为我国最为重要的国际运输通道，是铁路工人用生命书写的传奇。正是这种不折不挠、永不言弃的精神支撑着中华民族的抗日战争，最终迎来抗战的胜利。如果说法国修筑滇越铁路是向云南插进了一根“吸血管”的话，那么，抗战期间的滇越铁路，毫无疑问，是由“吸血管”变成“输血管”了。

1940年9月日军侵占越南进而封锁了滇越铁路

炸毁、拆除部分路段和收回铁路主权

  日军占领越南后，滇越铁路运输被切断。国民政府为了防止日军沿滇越铁路入侵云南，一方面调重兵在蒙自、河口、屏边、金平、文山、马关、麻栗坡、西畴、福宁一带布防；另一方面采取断然措施，成立滇越铁路线区司令部，军事接管滇越铁路滇段，炸毁河口大桥、河口隧道和白寨大桥，仅留下“人”字桥未毁，同时，拆除河口至碧色寨间177公里的铁轨， 拆下来的铁轨用在了上述滇缅铁路和叙昆铁路部分路段的铺设。

  1943年2月，法国维希政府公然蔑视中国主权，将广州湾“转让”给日本。按照1903年中、法两国签订的《滇越铁路章程》，中国在80年之后才能与法国商议收回滇越铁路及铁路一切产业。但在这时，面对法国政府的公然挑衅，国民政府毅然决定，8月1日，宣布与法国断绝外交关系，正式接管滇越铁路云南段。抗战胜利后，中、法两国签订《关于中越关系之协定》，规定宣布废除1903年的《滇越铁路章程》，将滇越铁路交还中国，这是在承认既成事实的基础上完成的外交程序。

  日军占领越南后，滇越铁路运输就无法出入越南了，此时的铁路便失去了作为国际运输通道的功能。在拆除了河口至碧色寨的铁轨后，就只剩下昆明至碧色寨287公里的铁路维持通车了。由于路轨器材没有来源，只能使用原有的陈旧设备维持行车，再加上管理混乱，致使运输效率低下，事故不断。仅1944年一年内就发生包括脱轨、翻车等严重事故在内的各种事故122件。其中，发生在宜良附近七拱坡翻车事故，列车翻车起火，烧死旅客140人，烧伤57人，为滇越铁路自通车以来，最大的一次行车伤亡事故。由于事故不断，货运、客运均受影响，昆明至碧色寨一线运输，常常时断时通，运量大不如前。