SARS-CoV-2 B.1.617谱系于2020年10月在印度出现,此后,它在印度的一些地区占据主导传播,并进一步传播到其他国家。该谱系包括三个主要亚型(B1.617.1、B.1617.2和B.1.617.3),并且在N端结构域(NTD)和受体结合域(RBD)存在不同的Spike蛋白突变,增加了逃逸的可能性。因此,B.1.617.2变种被认为比其他变种传播得更迅速。
B.1.617.2的特点是Spike蛋白中存在9个突变,这些突变可能会改变病毒与受体的结合,并逃避免疫反应。SARS-CoV-2病毒变异(VOCs)的突变增加了个体间的传播,已经取代了原始菌株。
ACE2受体主导了病毒融合和进入,成为中和抗体目标。第一个确定的变体包括D614G突变,它增强了病毒的传染性。随后VOCs出现在多个国家。B.1.1.7变体首次在英国被发现,B.1.351在南非,P.1系在巴西。它们携带增强Spike蛋白对ACE2亲和力的突变体,如N501Y,在三个变异体K417N/T、B.1.351和P.1中发现。RBD中的抗体逃逸突变体包括在B.1.351和P.1中发现的E484K,另一个B.1.247/B.1.429变体最初是在加利福尼亚州发现的。
5月27日,法国巴斯德研究所的研究人员发表在预印本biorxiv上的研究显示:辉瑞疫苗似乎可以预防印度病毒株,但是效果一般。
Delphine Planas et al, Reduced sensitivity of infectious SARS-CoV-2 variant B.1.617.2 to monoclonal antibodies and sera from convalescent and vaccinated individuals,BioRxiv(2021).DOI:10.1101/2021.05.26.445838
研究人员从一名印度返回的旅行者身上分离到了B.1.617.2变种,并检测了B.1.617.2变种对具有单克隆抗体(mabs)的人、新冠恢复期的患者、疫苗接种者血清中抗体的敏感性。单克隆抗体是由单一B细胞克隆产生的高度均一、仅针对某一特定抗原表位的抗体。B.1.617.2变种对某些单克隆抗体的中和有抵抗力,包括礼来单克隆抗体治疗药物bamlanivimab与B.1.617.2 Spike蛋白的结合容易受影响。
当症状出现后12个月内收集到康复期病人和辉瑞疫苗接种者的血清,结果发现:对B.1.617.2的有效力比B.1.1.7(英国发现的变异体)低3~6倍。接受了一剂阿斯利康疫苗人的血清中,几乎没有成功预防B.1.617.2变异体。
在此,研究人员评估了B.1.617.2分离株对NTD和Spike 受体结合区域的敏感性,包括4种已经临床批准的疫苗,并检测了恢复期个体和疫苗接种者血清中的中和力。结果发现变种在细胞外围修改了ACE2结合区域,以逃避抗体识别,并与ACE2进行有效结合。初步实验显示,在B.1.617.2感染的细胞中存在着很大的合胞体。