推荐理由

该研究提出了一种在RBFE计算中处理支架跳跃变换的新方法。该方法依赖于辅助约束，有效防止键断裂形成过程中极端键距的采样。此外，该方法可以使用现有的MD代码而无需修改。该方法有望扩大RBFE计算在药物发现和蛋白质表征过程中的影响并提高其适用性。

参考文献

Junjie Zou, Zhipeng Li, Shuai Liu, Chunwang Peng, Dong Fang, Xiao Wan, Zhixiong Lin, Tai-Sung Lee, Daniel P. Raleigh, Mingjun Yang, and Carlos Simmerling, Scaffold Hopping Transformations Using Auxiliary Restraints for Calculating Accurate Relative Binding Free Energies, Journal of Chemical Theory and Computation, 2021, ASAP. DOI:10.1021/acs.jctc.1c00214.

原文链接

https://doi.org/10.1021/acs.jctc.1c00214